課程資訊
課程名稱
高通量技術概論與數據分析
Introduction to high-throughput technique and data analysis 
開課學期
108-2 
授課對象
醫學院  基因體暨蛋白體醫學研究所  
授課教師
張以承 
課號
Genom7008 
課程識別碼
455 M0080 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五3,4(10:20~12:10) 
上課地點
基醫405 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。與江士昇、周祐吉、鄭婷仁、毛溪山、徐唯哲、劉傳崑、陳逸然、柯屹又合開。與郭錦樺、許家郎、陳沛隆、潘思樺、林靖愉合授
總人數上限:60人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1082Genom7008_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

生物體複雜度極高, 現代生物醫學逐漸由”hypothesis-driven”轉成”hypothesis-free”, 高通量技術將成為必備之知識, 整個基因組乃至於整個國家, 都成為分析的目標, 本課程介紹常用全基因組定序, 轉錄體, 蛋白體學, 與代謝體學方法。並介紹全基因組RNAi/CRISPER 篩選, 全基因組基因剔除小鼠資源, 高通量小分子藥物篩選, 虛擬分子對接, 與人體生物醫學資料庫乃至於與全民健保資料庫的連結。課程除了技術概論, 還包含數據分析之基本原理。 

課程目標
熟悉實驗室常用高通量技術之原理與分析技巧 
課程要求
簽到(50%)、報告(40%)、課堂討論 (10%) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
Nature Biotechnology: Computational Biology Primers http://www.liacs.nl/~hoogeboo/mcb/nature_primer.html 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
3/06  Introduction to basic concept
台大醫學院基蛋所 張以承 老師 
第2週
3/13  Transcriptome (1)
國家衛生研究院 江士昇 老師 
第3週
3/20  Transcriptome (2)
台大醫院醫研部 許家郎 老師 
第4週
3/27  Genome-wide association and linkage analysis
台大醫學院基蛋所 張以承 老師 
第5週
4/03  清明節放假 
第6週
4/10  Next-generation sequencing ( I )
台大醫學院基蛋所 陳沛隆 老師 
第7週
4/17  Next-generation sequencing ( II )
道品股份有限公司 劉傳崑 老師 
第8週
4/24  High-throughput small molecule screening
中研院基因體研究中心 鄭婷仁 老師 
第9週
5/01  Next-generation sequencing ( III )
中央研究院分生所 徐唯哲 老師 
第10週
5/08  Cheminformatics
中研院基因體研究中心 吳盈達 老師 
第11週
5/15  Proteomics (I)
台大醫學院基蛋所 潘思樺 老師 
第12週
5/22  Proteomics (II)
中央研究院農生中心 陳逸然 老師 
第13週
5/29  Metabolomics
台灣大學藥學系 郭錦樺 老師 
第14週
6/05  Lipidomics
臺大公衛學院 林靖愉 老師 
第15週
6/12  The Application of Computer Modeling for Drug Design
國家衛生研究院 柯屹又 老師 
第16週
6/19  Genome-wide RNAi/CRISPR screening
中研院基因體研究中心 周祐吉 老師 
第17週
6/26  端午節放假